Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF3AQ92664 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms