Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN4Q92575 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UBXN4Q92575 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms