Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMPDL3BQ92485 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPDL3BQ92485 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms