Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUFY2Q8WXA3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUFY2Q8WXA3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms