Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD1Q8NHV4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD1Q8NHV4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms