Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD53Q8N9V6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms