Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSL3Q8N5Y2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSL3Q8N5Y2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms