Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8N3U1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Q8N3U1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Q8N3U1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Q8N3U1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms