Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASSF3Q86WH2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms