Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC84Q86UT8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms