Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms