Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SETXQ7Z333 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SETXQ7Z333 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SETXQ7Z333 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SETXQ7Z333 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SETXQ7Z333 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms