Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HECW1Q76N89 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HECW1Q76N89 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms