Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC129Q6ZRS4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms