Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC141Q6ZP82 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms