Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SLC25A47Q6Q0C1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms