Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF613Q6PF04 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms