Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM88Q6PEY1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM88Q6PEY1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms