Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNNM4Q6P4Q7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNNM4Q6P4Q7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms