Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6P435 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6P435 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6P435 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6P435 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms