Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms