Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD4Q5VX71 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD4Q5VX71 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms