Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDE4DIPQ5VU43 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DIPQ5VU43 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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