Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC01545Q5VT33 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms