Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STRIP1Q5VSL9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms