Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC18Q5T9S5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC18Q5T9S5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms