Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1TD1Q5T7N2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
L1TD1Q5T7N2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms