Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RPL39P5Q59GN2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL39P5Q59GN2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms