Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC93Q567U6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC93Q567U6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms