Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TYSND1Q2T9J0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms