Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NREPQ16612 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NREPQ16612 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NREPQ16612 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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