Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNF239Q16600 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF239Q16600 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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