Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LY6EQ16553 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms