Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ASIC2Q16515 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms