Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATP6AP1Q15904 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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