Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATXN8Q156A1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATXN8Q156A1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms