Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFKBIBQ15653 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKBIBQ15653 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms