Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SS18Q15532 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SS18Q15532 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SS18Q15532 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SS18Q15532 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SS18Q15532 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SS18Q15532 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SS18Q15532 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SS18Q15532 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SS18Q15532 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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