Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BRD3Q15059 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms