Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERPUD1Q15011 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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