Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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COL19A1Q14993 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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COL19A1Q14993 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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COL19A1Q14993 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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COL19A1Q14993 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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COL19A1Q14993 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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COL19A1Q14993 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COL19A1Q14993 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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