Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GPNMBQ14956 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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GPNMBQ14956 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GPNMBQ14956 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GPNMBQ14956 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GPNMBQ14956 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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GPNMBQ14956 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GPNMBQ14956 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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