Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMCO1Q147U7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMCO1Q147U7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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