Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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GTF2H3Q13889 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2H3Q13889 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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