Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX3Q13761 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX3Q13761 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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