Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMS2P11Q13670 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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