Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP3B2Q13367 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B2Q13367 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms