Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SP140Q13342 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SP140Q13342 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SP140Q13342 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP140Q13342 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SP140Q13342 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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