Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SELENBP1Q13228 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms