Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SEMA3BQ13214 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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